體外轉(zhuǎn)錄合成siRNAs,其成本相對(duì)化學(xué)合成法比較低,是一種相對(duì)性價(jià)比高的篩選siRNAs的好方法,而且要比化學(xué)合成法更快的得到siRNAs。一旦得到DNA 雙鏈模版(這個(gè)還是需要DNA合成的,不過DNA合成的成本就比較低了),只要24小時(shí)轉(zhuǎn)染,不需要等很久。在體外構(gòu)建雙鏈RNA時(shí),分別在體外轉(zhuǎn)錄出正義和反義RNA,再將兩者退火,形成雙鏈RNA。體外合成的雙鏈RNA可以用脂質(zhì)體轉(zhuǎn)入細(xì)胞中。但有些細(xì)胞脂質(zhì)體轉(zhuǎn)移效果差,轉(zhuǎn)移到細(xì)胞內(nèi)的雙鏈RNA半衰期短。
這個(gè)方法的不足之處是實(shí)驗(yàn)的規(guī)模受到限制,雖然一次體外轉(zhuǎn)錄合成能提供足夠做數(shù)百次轉(zhuǎn)染的siRNAs,但是反應(yīng)規(guī)模和數(shù)量始終有一定的限制。而且和化學(xué)合成相比,還是需要占用研究人員相當(dāng)?shù)臅r(shí)間——化學(xué)合成只需要定購(gòu)就可以了。但體外轉(zhuǎn)錄得到的siRNAs只要較低的濃度就可以達(dá)到化學(xué)合成siRNAs較高濃度得到的效果。
適用:篩選siRNAs,特別是需要制備多種siRNAs,試驗(yàn)經(jīng)費(fèi)受限時(shí)。
不適用:1.需要大量的某個(gè)特定的siRNA。2.進(jìn)行長(zhǎng)期研究。