問(wèn)：如果誘餌蛋白對(duì)酵母細(xì)胞是有毒的，該怎么辦？
答：在有些情況下，在液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)不好的菌珠可以在固體培養(yǎng)基上生長(zhǎng)得很好。重懸克隆于1ml的SD/–Trp，接著將重懸液平鋪于5 個(gè)100-mm的SD/–Trp平板。在30℃下溫浴，直至平板上的克隆互相粘在一起。用5ml 0.5X YPDA刮下每塊板上的克隆，并收集到一管中。接著就使用這個(gè)細(xì)胞重懸液進(jìn)行正常的雜交反應(yīng)。
問(wèn)：我的誘餌蛋白能直接激活報(bào)告基因的表達(dá)，該如何處理？
答：該蛋白很可能有轉(zhuǎn)錄激活域，是個(gè)轉(zhuǎn)錄因子。這可以通過(guò)基因重組切掉轉(zhuǎn)錄激活域，然后重新檢測(cè)其是否自激活。但重組也有可能破壞蛋白之間的互作。
問(wèn)：轉(zhuǎn)化效率太低，怎么辦？
答：1. 檢測(cè)一下DNA的純度，如果可以的話，重新用乙醇純化。
2. DNA-BD/誘餌蛋白很可能是有毒的。
3. 不適當(dāng)?shù)呐囵B(yǎng)基，重新配制培養(yǎng)基，并做對(duì)照轉(zhuǎn)化。
4. 檢測(cè)pGBT9對(duì)照載體的轉(zhuǎn)化效率，放置于SD/–Trp平板上，轉(zhuǎn)化效率應(yīng)該在1 x 105 colonies/mg DNA以上。
問(wèn)：雜交效率不高，該如何處理？
答：在雜交中，預(yù)轉(zhuǎn)化的誘餌細(xì)胞的數(shù)量可能不夠。當(dāng)你對(duì)誘餌菌株進(jìn)行液體培養(yǎng)過(guò)夜時(shí)，應(yīng)挑選大的，新鮮的克隆進(jìn)行培養(yǎng)。經(jīng)過(guò)離心和重懸后，使用血球計(jì)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。密度應(yīng)該在1 x 109/ml。
一個(gè)甚至兩個(gè)融合蛋白對(duì)酵母細(xì)胞有毒。你可以通過(guò)重組方法來(lái)減輕毒性，同時(shí)又能保證蛋白的相互作用。或者使用表達(dá)水平較低的載體。也可以在瓊脂平板或?yàn)V膜上進(jìn)行雜交。但同時(shí)必須作雜交對(duì)照實(shí)驗(yàn)。
