一、 材料
不同來源的DNA(50ng/ul)。
二、設(shè)備
PCR儀,PCR管或硅化的0.5ml eppendorf管,電泳裝置。
三、試劑
1、隨機引物(10mer) (5umol/L):購買成品。
2、Taq酶:購買成品。
3、10xPCR 緩沖液:配方見第八章。
4、MgCl2 :25mmol/L。
5、dNTP:每種2.5mmol/L。
四、操作步驟:
1. 在25ul反應(yīng)體系中,加入
模板DNA 1ul (50ng)
隨機引物 1ul (約5pmol)
10xPCR Buffer 2.5ul
MgCl2 2ul
dNTP 2ul
Taq酶 1單位(U)
加ddH2O 至 25ul
混勻稍離心, 加一滴礦物油。
2. 在加熱至90℃以上的PCR儀中預(yù)變性94℃ 2分鐘, 然后循環(huán): 94℃ 1分鐘, 36℃ 1分鐘, 72℃ 1分鐘,共40輪循環(huán)。
3. 循環(huán)結(jié)束后, 72℃ 10分鐘,4℃保存。
4. 取PCR產(chǎn)物15ul加3ul上樣緩沖液(6x)于2% 瓊脂糖膠上電泳, 穩(wěn)壓50-100V(電壓低帶型整齊, 分辨率高)。
5. 電泳結(jié)束,觀察、拍照。
[注意] 1、電泳時一般RAPD帶有5-15條, 大小0.1-2.0kb。
2、 特異性的DNA帶可以克隆作為一個新的分子標(biāo)記應(yīng)用。
不同來源的DNA(50ng/ul)。
二、設(shè)備
PCR儀,PCR管或硅化的0.5ml eppendorf管,電泳裝置。
三、試劑
1、隨機引物(10mer) (5umol/L):購買成品。
2、Taq酶:購買成品。
3、10xPCR 緩沖液:配方見第八章。
4、MgCl2 :25mmol/L。
5、dNTP:每種2.5mmol/L。
四、操作步驟:
1. 在25ul反應(yīng)體系中,加入
模板DNA 1ul (50ng)
隨機引物 1ul (約5pmol)
10xPCR Buffer 2.5ul
MgCl2 2ul
dNTP 2ul
Taq酶 1單位(U)
加ddH2O 至 25ul
混勻稍離心, 加一滴礦物油。
2. 在加熱至90℃以上的PCR儀中預(yù)變性94℃ 2分鐘, 然后循環(huán): 94℃ 1分鐘, 36℃ 1分鐘, 72℃ 1分鐘,共40輪循環(huán)。
3. 循環(huán)結(jié)束后, 72℃ 10分鐘,4℃保存。
4. 取PCR產(chǎn)物15ul加3ul上樣緩沖液(6x)于2% 瓊脂糖膠上電泳, 穩(wěn)壓50-100V(電壓低帶型整齊, 分辨率高)。
5. 電泳結(jié)束,觀察、拍照。
[注意] 1、電泳時一般RAPD帶有5-15條, 大小0.1-2.0kb。
2、 特異性的DNA帶可以克隆作為一個新的分子標(biāo)記應(yīng)用。