綠色食品的范圍涵蓋有機(jī)食品，但有機(jī)食品不同于綠色食品，它們之間最主要的區(qū)別有：
² 生產(chǎn)、加工所依據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)不同。綠色食品是根據(jù)我國綠色食品生產(chǎn)、加工標(biāo)準(zhǔn)而進(jìn)行生產(chǎn)、加工的。而有機(jī)食品是根據(jù)國際有機(jī)農(nóng)業(yè)運(yùn)動聯(lián)合會（簡稱IFOAM）制定的有機(jī)食品生產(chǎn)加工標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行生產(chǎn)加工的，具有國際性。
² 我國綠色食品生產(chǎn)過程中可以允許使用高效低毒農(nóng)藥，也允許使用化學(xué)肥料。而有機(jī)食品的生產(chǎn)過程中禁止使用人工合成的農(nóng)藥、化肥和除草劑等，只能使用有機(jī)肥、生物農(nóng)藥和物理防治病蟲害。
² 管理方法上的差異。頒證的組織機(jī)構(gòu)、頒證的有效期、頒證和產(chǎn)量之間的關(guān)系上有所不同。