研讀論文的得失總結(jié)

在丁香園上看到一個關(guān)于研讀論文的得失的討論，覺得不錯，適當進行了一些歸納，但由于是討論，為各抒己見，有些我就將其進行了羅列，希望對大家有些幫助。至于各個發(fā)言者姓名，為了便于閱讀，大家可見原文。附件中有原文。
為什么要閱讀文獻        我們很多的時候，悶在實驗室閉門造車，實在不如稍抽出一點時間看看文獻，看看別人是否有同樣的困惑。我們的大老板說，要想有成績別無他法只有讀，讀，大量的讀文獻，尤其 外文的。
閱讀文獻的來源
    精研數(shù)據(jù)庫，對于文獻數(shù)據(jù)庫和專業(yè)數(shù)據(jù)庫應該深入研究。重要的如ISI，Medline, Ncbi等了。因人而異添加數(shù)據(jù)庫到你的收藏夾。
    做一個課題首先是要看專利的��！這是我的經(jīng)驗之談。通過研讀專利正文，可以體會申請人的研發(fā)思路；研讀專利權(quán)要求，可以少走彎路，還可以找出未覆蓋的漏洞，進一步提出自己的專利；有的專利還有參考文獻，可以了解這個專利的來龍去脈。
   了解與自己研究方向有關(guān)的機構(gòu),密切關(guān)注在該研究領(lǐng)域和方向的頂尖group所發(fā)表的論文并認真研讀。對于本研究領(lǐng)域的國際領(lǐng)袖人物和實驗室，應該多花一點時間去研究他們的主頁。
    可以在google上免費訂購你所感興趣的alert,他24小時更新，會不間斷的向你信箱發(fā)送網(wǎng)上出現(xiàn)該話題的文章。
    經(jīng)常上網(wǎng)看看最新的資訊說不準會激發(fā)你一時的靈感。
    定期讀幾篇cell ，nature,science還是很重要的，不要認為和自己專業(yè)無關(guān)的就不關(guān)心，其實目前生物醫(yī)學界的許多方法和思路是相通的，nature,science上最新的方法用到自己的領(lǐng)域上完全可能豁然開朗。
    對于你從事的領(lǐng)域的重點雜志（NO.1）（<<國外醫(yī)學>>各個分冊每其都有許多可讀的綜述，注意自己專業(yè)的核心刊的專輯,增刊,很重要!），應該是每一期的每一篇文章都閱讀一下，然后是重點閱讀。如果沒有那么多的時間，至少每篇的TITLE & ABSTRACT應該閱讀的。
    特別要注意中文綜述文章后的英文參考文獻，可以用回顧性的方法查找該問題的最初起源及奠基性文章。
    查閱大量外文文獻，然后從文獻的文獻再去查找，如此往復循環(huán)，你的idea不知不覺中就被啟發(fā)開來。我們老板說過，看文獻，最重要，最有權(quán)威，也最有深度的是什么，就是你查找的文獻的文獻。
    讀文獻一定要注意文章后面列出的參考文獻,按圖索驥,就很易找到更多文獻,而且被引次數(shù)越多的越重要!!通過搜索參考文獻的作者,期刊目次找到更多該領(lǐng)域的文章.
如何查找閱讀文獻
課題未定：
    我很是崇拜神經(jīng)所蒲教授的觀點，閱讀文獻從教科書開始-找到自己最感興趣的問題，查找相關(guān)綜述，你會發(fā)現(xiàn)書上一些所謂的成熟觀點，在綜述中是“推測”，然后找原始文獻，你回發(fā)現(xiàn)，有許多實驗證據(jù)是在當時條件不夠的情況下的初步探索。如果你發(fā)現(xiàn)這樣的問題，一個流行觀點沒有使用目前、最新技術(shù)驗證，你去驗證一下，回有兩種結(jié)果：證實，那你就是用最新技術(shù)驗證一個很正確的觀點，給他提供了新證據(jù)，這屬于好工作，另外你發(fā)現(xiàn)前人的觀點有錯誤，那你就找到一條將來的科研方向，繼續(xù)做下去，搞定！
    一定得知道自己所作的方向現(xiàn)在世界上是個怎樣的研究現(xiàn)狀---做到了何種程度,還有那些關(guān)鍵問題急待解決.這一點對于自己找題目的戰(zhàn)友,我覺得尤為重要!
課題已定：
    首先要做的是尋找權(quán)威雜志上相關(guān)研究領(lǐng)域權(quán)威人士撰寫的綜述類文章。這類文章信息量大，論述精辟，讀后不但有助于掌握相關(guān)研究的重點和焦點內(nèi)容，而且能幫助我們掌握研究領(lǐng)域的大方向和框架，哪些人、哪個大學或研究所、在哪個方向比較強等等；其次是泛讀摘要，挑選最相關(guān)的進行精讀。精讀文章同時做筆記和標記是非常關(guān)鍵的，因為好文章可能每讀一遍就有不同的收獲，每次的筆記加上心得最后總結(jié)起來就會對自己大有幫助；再次是針對不同的需要對論文進行泛讀和跳讀。
     涉足一些和專業(yè)有點瓜葛但有相當距離的領(lǐng)域。我一般研讀相關(guān)文獻的程序是：1、對該領(lǐng)域有較多介紹的中文成書（資料一般是比較老，如果是新書通常匯集了最近5到10年的主要研究內(nèi)容和結(jié)果）讀后可以對這個領(lǐng)域發(fā)展歷史和近期狀況有個全面的了解，一些專門的術(shù)語和英文單詞也有了概念。2、根據(jù)研究內(nèi)容通查最近3年的中文期刊，主要是通過看綜述了解最近進展和一些國外發(fā)表文章的人名和期刊名，還有國內(nèi)做到什么程度了，為請該類項目打個基礎(chǔ)。你可以知道國內(nèi)那些同行在做這工作.如果實驗中碰到一些具體的細節(jié)問題的話,你可以聯(lián)系他們,這便可以使你避免走不必要的彎路.3、根據(jù)上面的學習掌握的專業(yè)詞匯，人名，期刊名查國外文獻。我的體會是，如果那個領(lǐng)域和原來專業(yè)距離比較遠，那么一來就去查外文的文獻往往找不出好東東，特別是一些關(guān)鍵詞常有臆斷的情況，導致檢索效果不好。
    我覺得對于自己要研究的不熟悉的內(nèi)容，例如某種疾病，那么你得首先翻翻中文教科書，要對這一種疾病有一個大概的了解，這樣在你以后閱讀文獻時會很有幫助。然后，在上網(wǎng)查一些你的老板或你自己想要做的題目的相關(guān)方面的中文綜述，也算是對教科書內(nèi)容的補充。同時也讓你有可能觸及到國內(nèi)目前的此方面的前沿。這時候，你可以開始閱讀一些外文的綜述，看一看國外的研究情況和進展�；蛟S，此時你會對你想要研究什么有更進一步的了解。接下來，就可以閱讀一些國外的原始論著，它將會告訴你如何去完成你要研究的題目。等到文獻量積累到一定程度后就可以開始你的課題了。但千萬別忘了，時刻關(guān)注你正在研究的相關(guān)內(nèi)容研究進展，它可能會給你的課題新的補充。最后一條，看文獻，編上號，做好筆記。
    對于一個尚不熟悉領(lǐng)域的課題,先找相關(guān)的綜述,綜述是了解該領(lǐng)域最快的途徑,因為教材具有滯后性,而論著又偏重于某一點,優(yōu)秀的綜述可以作教材讀的.
讀文獻的順序，當然還是從中文到外文，畢竟，中文是自己的母語，容易看懂，也容易有成就感。
    文章內(nèi)容是從綜述到論著。一般花上一兩個小時，可以查一堆文獻，先把它們的摘要整理出來，甚至打印出來，根據(jù)摘要，可以初步判斷哪些是自己決定要的。然后再到網(wǎng)上找全文，找不到再去圖書館，還找不到就發(fā)E-mail給國外的同學，一般都能獲取到。對于自己感興趣的問題，不僅要看原文，還要看它的參考文獻，一般深追上幾篇文章，對于想了解的問題也就知道個大概了。在讀文章的過程中，當然要做些筆記，建一個word文檔，做些復制拷貝的工作便可，這樣做的好處是，回頭就不必再花好多時間去找你的論據(jù)或論點。
如何閱讀文獻：
看文章時作筆記
    閱讀筆記本可按不同的內(nèi)容進行分類摘錄，如:進展,研究方法，實驗方法，研究結(jié)果等，并可加上自己的批注。對于筆記要定期總結(jié)（總結(jié)過去已經(jīng)做過什么-------做到心中有數(shù)；現(xiàn)在進展到什么程度---------做到知己知彼；從中發(fā)現(xiàn)別人的優(yōu)點和不足。預測將來的熱點和發(fā)展方向--------才能準確出擊，找到自己的方向和目標�。�。我們要著眼于將自己的成果往SCI上發(fā)，所以對一些經(jīng)典的陳述，要有選擇性的標記并記下來。另外，有的時候想到的思路，閃過的想法，作筆記記下來，隨時查一查，可能時間久了自然就有新的看法。
勤思考
    不單單是了解別人做了什么，還要考慮別人沒做什么，或者他的實驗能不能和他的結(jié)論吻合，數(shù)據(jù)可不可靠等等。用圖表的方式將作者的整個邏輯畫出來，逐一推敲，抱著一種挑的心態(tài)想。帶著挑剔的眼神去讀文獻，不要盲目崇拜，有些東東自己作作，發(fā)現(xiàn)并不是那么回事，自己要動手，自己更要動腦�？次墨I中懂得抓重點，找思路。主要是學習別人的IDEA。也就是看了文獻問幾個問題，文章的技術(shù)突破口在那里。比如一大堆專利講了很多種分離方法，關(guān)鍵不是看它先做什么后做什么，而是想這個分離方法的依據(jù)是什么，為什么人家會想到這個方法，是不是還有其他方面的物性可以利用為分離的依據(jù)。
多與人交流，是提升自己的極好方式
    和導師談談你的想法，交流一下各自所了解的所在領(lǐng)域某一方向的研究進展；與相關(guān)方向的牛人談談，對自己的啟發(fā)要比看文獻大的多。不僅與本領(lǐng)域的牛人交談，還抓住機會與其他領(lǐng)域的牛人交談，牛人的一句話，有時你讀半年書都讀不來的。特別是其他領(lǐng)域的牛人，他沒準就給你一個金點子，特別是在中國，牛人一般對外行人不怎么保守。集體討論非常必要，找?guī)讉�志同道合的人一起，文獻人人都有一份，每人分工讀不同的文獻，然后大家坐到一起。順序開講，互相討論。這樣，文獻量是不是就成N次方增加了�。�！
比較閱讀
    觀點相反的論文可以參照來讀，品味一下雙方的觀點。還有就是與原著同時發(fā)表的其他專家的述評、原著發(fā)表后的讀者質(zhì)疑，都應當和原著一起讀。比較一下，就可以看到自己的差距了。
    讀論文的時候最有意思的事情是發(fā)現(xiàn)“一稿兩投”。我的意思是不少作者把同一科研數(shù)據(jù)寫成相似主題的不同論文，或是在前面的基礎(chǔ)上又有了新的發(fā)展變化。這時，如果你的課題與此類似，你的好運也就來了。因為能通過深入比較這幾篇文章的異同，發(fā)現(xiàn)作者（或科研小組）對同一組數(shù)據(jù)的不同看法、思路的演變，或者發(fā)現(xiàn)作者本想隱藏的“真正”方法。我就是在分析了同一科研小組的類似實驗后，迅速發(fā)現(xiàn)自己實驗失敗的關(guān)鍵原因，短時間內(nèi)成功完成動物模型制作的，為進一步實驗打下了基礎(chǔ)。
    做技術(shù)的要善于比較和發(fā)現(xiàn)，一些技術(shù)含量高文獻，不可能把要點都報道出來，中文如此，英文也是如此。比如一篇專利中有很多的Sample,而每個的條件或配方都不同，這時要多比較幾個同類文獻，看其共同點在那里。這點在制藥和表面活性劑行業(yè)還是要注意的。
    全面參考國外文獻。一定要清楚,國外文獻也有一些不可信的文章;另外一種現(xiàn)象就是關(guān)于重點的關(guān)鍵的東西他會略去不寫,有時一些細節(jié)的東西他也不會寫的.問題是各人省略的關(guān)鍵和細節(jié)不盡相同,你便從對比中發(fā)現(xiàn)他們研究的脈絡和問題的關(guān)鍵所在。
單篇文章閱讀順序及側(cè)重
    論文閱讀順序：1. 摘要 引文 引用的主要信息，研究背景。2. 圖表 了解主要數(shù)據(jù)和解釋。3. 討論和結(jié)論 將圖表和結(jié)論聯(lián)系起來，根據(jù)圖表判斷結(jié)論是否恰當。4. 結(jié)果 詳細閱讀結(jié)果，看數(shù)據(jù)是如何得到的，又是如何分析的。5. 材料和方法 詳細閱讀材料和實驗方法，看實驗是如何進行的。6. 討論和結(jié)果 進一步掌握論文，注意討論中的關(guān)于從已知的知識和研究如何解釋本文獲得的結(jié)果。另外對于論文中大量的圖表來說，當你能夠重新畫出這張圖，并且能用自己的語言解說這張圖，表明就讀懂了。
    一篇論文中最重要的部分依次是: 圖表，討論，文字結(jié)果，方法�，F(xiàn)在生命科學中的雜志對圖表的要求都很高，必須做到僅通過閱讀圖表及其說明文字即能把握文章的方法、結(jié)果，再結(jié)合讀者自己的原有知識，就大概知道其implication了。這符合現(xiàn)代人必須在最短的時間內(nèi)把握最必要的信息的要求。因此，在某個領(lǐng)域做了一段工作后，定期查新得到的文章只須看摘要、圖表即可， 個別涉及新方法或突破性結(jié)果，再看討論，文字結(jié)果和方法。這也提示我們在寫外文文章時，注重圖表及其說明文字，做到形象化、信息最大化。
    自己熟悉的領(lǐng)域：最省事的是只看摘要，因為依靠背景知識通過摘要即可大致勾勒出文章內(nèi)容，但有時這是不夠的，相對省事的方法是細看摘要，略讀前言，再看結(jié)果中的圖表，最后讀一下自己感興趣的討論部分。但如果文章對自己很有意義，那就應該通讀全文了。
    如在尋找課題階段，重點讀討論和結(jié)論以及展望，在課題設(shè)計階段，主要是材料和方法。若只需了解一下該研究的思路,可選取摘要及引文與結(jié)論進行泛讀。
個人的經(jīng)驗是盡量去把握作者的研究思路，然后是學習他們的分析方法，最后是學習寫作技巧和寫作語言方式等。
    文章的討論部分真是很重要，如果時間稍微充裕點，建議研讀和模仿牛人paper的討論部分。不同的人對同樣的數(shù)據(jù)可能有不同看法和分析方式，圖表的趨勢解析，論據(jù)的組合，都是非�？垂αΦ牟糠�，我們老板經(jīng)常說：如果某篇SCI級別的文章讓我們這些菜鳥來寫，可能發(fā)國內(nèi)核心都非常困難。
    我覺的最重要的是理解討論中的精髓，這是作者idea創(chuàng)新性以及與舊有的實驗結(jié)果比較的關(guān)鍵部分，可以看出作者設(shè)計此實驗的思路，在作出比較以后，對自己的課題會有很大啟發(fā)。
    除了文章內(nèi)容，還要學習人家寫作的方法和格式等等，比如同樣一個觀點，別人有可能表達的很地道，同樣一個圖表，別人做的很漂亮，尤其是老外的文章，給老外投稿，人家的修改意見要求文字通俗易懂，帶有一定的科普性，即使不是本專業(yè)的人，也能大致看懂；然后還要求多用簡單句，能用簡單句說明的問題，就不要用復合句，在同一句子中，最好不要讓同一個詞匯或短語重復出現(xiàn) ...... 最后想說的一點，就是注意中文和外文的互相印證，注意一些專業(yè)詞匯的翻譯，注意用詞的恰當和簡潔，久而久之，對于提高自己的外語水平，也是大有裨益的。
文獻追蹤的重要性
    在現(xiàn)在這個信息時代，往往你的idea別人也會有不謀而和的時候，所以要特別關(guān)注這個領(lǐng)域的最新動向。在抓緊使自己出成果的同時，隨時根據(jù)有可能出現(xiàn)的“撞車”進行調(diào)整，做到心中有數(shù)。和自己課題相關(guān)的文章一定要勤跟蹤，現(xiàn)在國外的科研做得又快又漂亮，我們在做到心中有數(shù)的情況下，可以揚長避短，作出新東西來。了解與自己研究方向有關(guān)的機構(gòu),密切關(guān)注在該研究領(lǐng)域和方向的頂尖group（研究團體以及牛人）所發(fā)表的論文。對于數(shù)據(jù)庫的定題、定詞地定期搜索，這樣才能保證你不丟下每一篇重要的文獻。文獻總要緊密結(jié)合自己的方向為方向服務!
已定課題的實施
1、得到一個大概方向。
2、查相關(guān)中文綜述，查看國內(nèi)有誰或哪個單位在做相關(guān)內(nèi)容。
3、查外文綜述，比較一下，畢竟外文可能會更詳盡一些，看看大家對什么感興趣。
4、查較關(guān)鍵的參考文獻，注意雜志和作者的權(quán)威性、引用次數(shù)
5、重檢相關(guān)全文，注意研究方法、和技術(shù)路線，討論中存在什么問題
6、根據(jù)本人所能控制的資金和本地技術(shù)資源考慮我能做什么，怎么做
7、再進一步緊縮范圍，有一個框架圖
8、根據(jù)框架圖再進一步查外文原文以明細節(jié)。

實驗思路永遠要走在實驗之前，凡事想好再作，一定沒錯！
在實驗方案的設(shè)計和實驗細節(jié)方面一定要多下功夫,力求用實驗室最成熟的技術(shù).對于一些自己沒有做過的實驗,一定要吃透原理,再下手不遲,切記盲目.有些實驗若自己實驗室確有困難,可以考慮合作,因為一個人不可能在短時間內(nèi)把什么都做好.我的體會是,有時就需要請教專家!