一、自理報關(guān)
自理報關(guān)企業(yè)進(jìn)行網(wǎng)上錄入、申報、查詢、打印報關(guān)單，以及網(wǎng)上查詢海關(guān)回執(zhí)等操作。
業(yè)務(wù)流程：
1、自理報關(guān)單位錄入業(yè)務(wù)流程：
(1)、自理報關(guān)單位持“報關(guān)單錄入”權(quán)操作員卡的操作員進(jìn)入中國電子口岸“報關(guān)單錄入”界面，可先下載本企業(yè)征免稅證明、加工貿(mào)易手冊或加工區(qū)備案清單后，脫機(jī)錄入報關(guān)單數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)暫存在本地數(shù)據(jù)庫)；
(2)、錄入并提交后將錄入的報關(guān)單數(shù)據(jù)信息上載到數(shù)據(jù)中心，進(jìn)入自理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程；
2、自理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程：
自理報關(guān)單位持“報關(guān)單審核申報”權(quán)操作員卡的操作員進(jìn)入中國電子口岸的“報關(guān)單審核申報”界面，對報關(guān)單的邏輯性、填報的規(guī)范性進(jìn)行審核，確保報關(guān)單可以向海關(guān)進(jìn)行申報。若審核不通過，則需要將報關(guān)單下載本地進(jìn)行修改，修改后的報關(guān)單需重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且需要重新進(jìn)行審核。審核通過后進(jìn)入自理報關(guān)申報確認(rèn)業(yè)務(wù)流程；
3、自理報關(guān)申報確認(rèn)業(yè)務(wù)流程：
(1)、自理報關(guān)單位持“報關(guān)單申報確認(rèn)”權(quán)操作員卡的企業(yè)管理人員進(jìn)入中國電子口岸“報關(guān)單申報確認(rèn)”界面，對報關(guān)單進(jìn)行確認(rèn)申報操作，經(jīng)“申報確認(rèn)”后的報關(guān)單通過公共數(shù)據(jù)中心傳海關(guān)內(nèi)部網(wǎng)。
如果申報確認(rèn)時認(rèn)為報關(guān)單的填制不符合邏輯，需要將報關(guān)單數(shù)據(jù)下載到本地進(jìn)行修改，修改完畢之后需要將數(shù)據(jù)重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且重新進(jìn)行審核和申報確認(rèn)。
(2)、自理報關(guān)單位打印出經(jīng)海關(guān)審核通過的報關(guān)單，并攜帶其他單證去海關(guān)辦理其他通關(guān)手續(xù)。
二、委托報關(guān)
受理委托報關(guān)的單位有：
1、專門從事報關(guān)服務(wù)的企業(yè)，即專業(yè)報關(guān)企業(yè)；
2、對外貿(mào)易倉儲、國際運(yùn)輸工具、國際運(yùn)輸工具服務(wù)及代理等業(yè)務(wù)，兼營報關(guān)服務(wù)業(yè)務(wù)的企業(yè)，即代理報關(guān)企業(yè)。
受理委托報關(guān)的單位代理辦理的報關(guān)手續(xù)，包括：報關(guān)單錄入時的備案數(shù)據(jù)下載協(xié)議、報關(guān)單審核委托書、報關(guān)單申報委托書或報關(guān)單審核申報和申報確認(rèn)委托書。并向海關(guān)出具委托單位的報關(guān)委托書。
報關(guān)單錄入\申報子系統(tǒng)提供進(jìn)出口單位通過網(wǎng)上填寫申報委托書或者備案數(shù)據(jù)下載協(xié)議，委托有權(quán)代理報關(guān)業(yè)務(wù)的單位代其辦理某項(xiàng)報關(guān)業(yè)務(wù)，如：報關(guān)單錄入、報關(guān)單審核、報關(guān)單申報或報關(guān)單審核和申報。有權(quán)進(jìn)行代理報關(guān)業(yè)務(wù)的單位可在網(wǎng)上 接受并確認(rèn)委托單位的報關(guān)委托申請，并在備案數(shù)據(jù)下載協(xié)議和報關(guān)委托書的授權(quán)范圍內(nèi)代理委托單位網(wǎng)上辦理相應(yīng)的報關(guān)業(yè)務(wù)。
委托報關(guān)網(wǎng)上業(yè)務(wù)流程(在進(jìn)行此項(xiàng)操作前必須先按照網(wǎng)上報關(guān)委托業(yè)務(wù)的流程建立委托關(guān)系)：
1、 代理報關(guān)單錄入業(yè)務(wù)流程：
(1)、代理報關(guān)單位持“報關(guān)單錄入權(quán)”操作員卡的操作員進(jìn)入中國電子口岸“報關(guān)單錄入”界面，在備案數(shù)據(jù)下載協(xié)議的授權(quán)范圍內(nèi)下載本委托單位的征免稅證明、加工貿(mào)易手冊或加工區(qū)備案清單后，脫機(jī)錄入報關(guān)單數(shù)據(jù)(數(shù) 據(jù)暫存在本地數(shù)據(jù)庫)；
(2)、錄入并提交后將錄入的報關(guān)單數(shù)據(jù)信息上載到數(shù)據(jù)中心；
2、代理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程： 代理報關(guān)單位持“報關(guān)單審核申報”權(quán)操作員卡的操作員進(jìn)入中國電子口岸的“報關(guān)單審核申報”界面，對報關(guān)單的邏輯性、填報的規(guī)范性進(jìn)行審核，確保報關(guān)單可以向海關(guān)進(jìn)行申報。則需要將報關(guān)單下載本地進(jìn)行修改，修改后的報關(guān)單需重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且需要重新進(jìn)行審核。審核通過后進(jìn)入自理報關(guān)申報確認(rèn)業(yè)務(wù)流程；
3、代理報關(guān)申報確認(rèn)業(yè)務(wù)流程：
(1)、代理報關(guān)單位持具“報關(guān)單申報確認(rèn)”權(quán)操作員卡的企業(yè)管理人員進(jìn)入中國電子口岸“報關(guān)單申報確認(rèn)”界面，對報關(guān)單進(jìn)行確認(rèn)申報操作，經(jīng)“申報確認(rèn)”后的報關(guān)單通過公共數(shù)據(jù)中心傳海關(guān)內(nèi)部網(wǎng)。如果申報確認(rèn)時認(rèn)為報關(guān)單的填制不符合邏輯，需要將報關(guān)單數(shù)據(jù)下載到本地進(jìn)行修改，修改完畢之后需要將數(shù)據(jù)重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且重新進(jìn)行審核和申報確認(rèn)。
(2)、代理報關(guān)單位打印出經(jīng)海關(guān)審核通過的報關(guān)單，并攜帶其他單證去海關(guān)辦理其他通關(guān)手續(xù)。
三、轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸提前錄入、申報業(yè)務(wù)
報關(guān)單錄入、申報子系統(tǒng)提供自理報關(guān)企業(yè)、專業(yè)報關(guān)企業(yè)、代理報關(guān)企業(yè)網(wǎng)上辦理所需的轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸提前錄入、 申報業(yè)務(wù)，但代理報關(guān)企業(yè)、專業(yè)報關(guān)企業(yè)應(yīng)用該系統(tǒng)進(jìn)行轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸報關(guān)單、轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸申報單的提前錄入、申報時，必須事先通過本系統(tǒng)與委托方簽定委托報關(guān)協(xié)議。
網(wǎng)上轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸錄入、申報業(yè)務(wù)流程：
1、自理報關(guān)企業(yè)轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸錄入、申報網(wǎng)上業(yè)務(wù)流程：與網(wǎng)上自理報關(guān)業(yè)務(wù)流程類同；
2、代理報關(guān)企業(yè)轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸錄入、申報網(wǎng)上業(yè)務(wù)流程：與委托報關(guān)業(yè)務(wù)網(wǎng)上流程類同；
四、報關(guān)單清單錄入申報業(yè)務(wù)
報關(guān)單清單錄入\申報子系統(tǒng)提供給IT企業(yè)或其他需要報關(guān)單清單業(yè)務(wù)的企業(yè)，其主要功能包括：報關(guān)單清單錄入、申報；報關(guān)單清單的綜合查詢；海關(guān)回執(zhí)的查詢等。
網(wǎng)上報關(guān)單清單業(yè)務(wù)流程：
1、報關(guān)單清單單位的錄入員進(jìn)入中國電子口岸“報關(guān)清單”頁面，下載備案數(shù)據(jù)后，脫機(jī)錄入報關(guān)單清單，錄入完畢，將所錄的報關(guān)單清單數(shù)據(jù)信息上載到數(shù)據(jù)中心；
2、報關(guān)單清單單位的操作員持有操作員卡進(jìn)入中國電子口岸“報關(guān)清單”頁面，查詢所上載報關(guān)單清單的回執(zhí)信息。如該報關(guān)單清單回執(zhí)狀態(tài)為已通過，則下載已通過的報關(guān)單清單，以進(jìn)行報關(guān)單的操作。