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生長能力的檢查是指采用低菌量的特定菌種挑戰(zhàn)培養(yǎng)基的菌落回收率，一般而言所謂低菌量是指至少<100 CFU，而所謂特定菌種是指藥典規(guī)定的標準菌株、控制菌以及不合宜微生物(objectionable)。無論滋養(yǎng)性培養(yǎng)基(例如TSA)或是選擇性培養(yǎng)基(例如麥康凱瓊脂，MacConkey agar)都需要執(zhí)行生長能力的檢查，然而對于選擇性培養(yǎng)基來說，由于目標菌的回收率常常低于滋養(yǎng)性培養(yǎng)基，因此國際藥典并未針對選擇性培養(yǎng)基的回收率有明確的要求(非強制>50%)，但是對于選擇性培養(yǎng)基的抑制能力與指示能力則有特別要求。操作這三種培養(yǎng)基效能檢查時，必須注意到接種菌株種類、培養(yǎng)與觀察時間的要求是不同的。舉例來說，生長能力的檢查必需在藥典規(guī)定的最低時間內(nèi)完成培養(yǎng)；抑制能力的培養(yǎng)時間則不低于藥典規(guī)范的最長時間培養(yǎng)；抑制能力須接種>100 CFU（常用的濃度為1,000 CFU左右）的非目標菌株用以挑戰(zhàn)其抑制力。
一般來說，微生物限度檢查與環(huán)境監(jiān)控培養(yǎng)基通常使用TSA與SDA平板，至少需要5株藥典菌株，而無菌性試驗則需要6到7種菌株(方法合適性采用大腸桿菌)。然而，除了藥典規(guī)范的菌株以外，無菌性檢查用的培養(yǎng)基最好能夠再增加廠內(nèi)分離菌株加以挑戰(zhàn)。最佳的選擇可以是過去曾經(jīng)造成無菌性試驗失敗的污染菌株，或是曾經(jīng)在該環(huán)境(通常為A、B級區(qū))所分離的菌株。特別要注意的是，若細胞制劑/治療產(chǎn)品采用了替代無菌性試驗方法，例如Bact/Alert血培養(yǎng)設(shè)備，在歐洲藥典EP 2.6.27的規(guī)定中，部分菌株與傳統(tǒng)無菌性試驗不同，例如新增了在臨床常見的厭氧感染菌Bacteroides fragilis ATCC 25285；對于環(huán)境監(jiān)控用培養(yǎng)基，雖然藥典并未強制規(guī)范挑戰(zhàn)菌株為何，但一般來說都是以微生物限量檢查常見的五種菌株來檢查(金葡、銅綠、枯草、黑曲霉與白念)，然而基于環(huán)境中常態(tài)菌叢通常為非藥典建議QC菌株，例如微球菌(Micrococcus)、表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis)、棒狀桿菌(Corynebacterium)甚至霉菌及酵母菌等，且基于對消毒劑效能的考慮，建議至少增加2至3種非藥典所建議的廠房環(huán)境菌株加以挑戰(zhàn)培養(yǎng)基效能。若是廠內(nèi)已經(jīng)建立有不合宜微生物名單(objactionable organism list)，或是發(fā)現(xiàn)了不適當?shù)木N(例如霉菌、革蘭氏陰性桿菌等)都可以采用作為環(huán)境監(jiān)控用培養(yǎng)基的效能檢查用菌種。
對于制藥用水的檢查方式，歐美各國對于培養(yǎng)基的選擇各有不同的評論。但目前比較多藥廠采用的還是R2A與PCA兩種培養(yǎng)基，部分藥廠對于源水質(zhì)量的檢查還會增加使用mEndo agar或是顯色培養(yǎng)基(chromogenic agar)來評估其革蘭氏陰性桿菌。由于存在于水中的微生物通常處于營養(yǎng)缺乏(starvation)或是高壓力(stressed)狀態(tài)，菌種生長較為緩慢，菌落不明顯，所以培養(yǎng)條件有些許不同，例如某些藥廠采用營養(yǎng)較低的R2A培養(yǎng)基低溫培養(yǎng)4-7天，而不是選擇常用的TSA或是PCA培養(yǎng)基培養(yǎng)3天。挑戰(zhàn)用于制藥等級水檢查用培養(yǎng)基的菌種，考慮的因子會跟微生物特性有很大的關(guān)系。容易形成生物膜(Biofilm)的假單胞菌(Pseudomonas)、甲基桿菌(Methylobacterium)、羅爾斯頓氏菌(Ralstonia)、寡養(yǎng)單胞菌(Stenotrophomonas)應(yīng)該被列為培養(yǎng)基檢查的菌株，例如日本藥典建議使用甲基桿菌與假單孢菌；革蘭氏陽性菌通常不是水中微生物的主角，它們不耐存活于液態(tài)環(huán)境，但是帶有內(nèi)孢子的革蘭氏陽性芽孢菌，由于能夠耐熱與UV照射，所以也可以作為培養(yǎng)基挑戰(zhàn)之用，例如歐洲藥典對于R2A的建議是使用枯草桿菌來挑戰(zhàn)；不形成生物膜的革蘭氏陰性菌且"非"假單孢菌屬，例如大腸桿菌群，雖然這些細菌大部份會在水系統(tǒng)的處理過程被去除(或是無法存活)，但這些腸桿菌科成員卻是源水潔凈程度的重要指標。然而，藥典并沒有建議使用何種培養(yǎng)基來檢查這類微生物。或許常用于環(huán)檢規(guī)范的mEndo agar或是顯色培養(yǎng)基或食品檢驗的VRBGA可以列為參考，一來這些培養(yǎng)基有標準方法可以依循，二來這些培養(yǎng)基也已經(jīng)有質(zhì)量管理規(guī)范，例如美國APHA公共衛(wèi)生協(xié)會。
菌株的選擇 3 (在控制菌用培養(yǎng)基效能方面)
控制菌的檢查需要使用到許多選擇性培養(yǎng)基，例如麥康凱培養(yǎng)基(MacConkey agar/broth)、RV沙門增菌液體培養(yǎng)基(RV broth)、溴化十六烷基三甲銨瓊脂(cetrimide agar)等等。由于這些培養(yǎng)基可能同時具備有目標菌生長能力、非目標菌抑制能力，甚至具備有指示能力，所以其成份組成通常較為復(fù)雜，配制較為繁瑣，在效能檢查上也更為復(fù)雜。以甘露醇氯化鈉瓊脂培養(yǎng)基(Mannitol salt agar)為例，需要使用金黃色葡萄球菌來挑戰(zhàn)其生長與指示能力，用大腸桿菌挑戰(zhàn)該培養(yǎng)基的抑制能力。
生長能力的檢查必需在藥典規(guī)定的最低時間內(nèi)完成培養(yǎng)(<18小時)；抑制能力則須接種>100 CFU的非目標菌株且不低于藥典規(guī)范的最長時間培養(yǎng)(>72小時)。值得注意的是，2015年版中華人民共和國藥典對于指示能力的培養(yǎng)時間與其他國際藥典不同，國際藥典，例如USP是規(guī)定指示能力的培養(yǎng)時間可以在藥典的規(guī)定時間以內(nèi)(18-72小時)，但2015年版中華人民共和國藥典則是更嚴格要求低于18小時需觀察得到(黃色菌落與黃色圈環(huán))。對于液態(tài)增菌培養(yǎng)夜，例如TSB、MacConkey broth、RV broth對指示能力則沒有明確要求。除了目前2015年版中華人民共和國藥典所規(guī)范的七類控制菌檢查以外，對于伯克氏菌(Burkholderia)以及其他不合宜微生物(objectionable)檢查用的培養(yǎng)基，也應(yīng)建立一套培養(yǎng)基效能檢查以及方法合適性檢查的方法。
