指測計酵母、細菌等的細胞數。有總菌計數和活菌計數兩種計數法。后者是測計試樣中的活細菌數。二者都是先把試樣稀釋成適于測計的濃度，再用種種方法進行細胞數的測計。一般認為用細胞計數器測計更為精確。有的方法是把細胞用血球容量計進行離心沉淀，從其刻度的容積進行換算；還有一種方法是比濁法。在測計固氮細菌時，可用凱氏定氮法測定有機氮（或是蛋白態(tài)氮），然后換算成細菌數。進行活菌計數時，先把樣品稀釋，然后將一定量稀釋樣品混入依菌性質制成的溶融狀態(tài)的瓊脂培養(yǎng)基中進行平面培養(yǎng)，再根據菌落數進行統(tǒng)計。對已鑒別過的菌種或具有某種特定性質的細菌來說，活菌計數比較簡單，但對土壤微生物區(qū)系量的分析就比較復雜了。
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