親緣關(guān)系近的兩個個體之間的交配叫近親交配或近交。如果兩個體在3代（或5代）內(nèi)的直系或旁系中能找到共同祖先，則稱這兩個體的親緣關(guān)系近。在近交中，根據(jù)交配個體間親緣關(guān)系相對遠近的程度，較常見的有表兄妹交配、半同胞交配、全同胞交配和自體交配（自交）。近交的基本遺傳效應(yīng)是導(dǎo)致群體中的純合體頻率上升或雜合體頻率下降�，F(xiàn)以自交為例說明。假定試驗以基因型為Aa的一株小麥開始（自交0代），則各自交世代的基因型及其頻率變化如下：
由上表可知：自交0代，1代，…，n代的雜合體頻率分別是(1/2)0，(1/2)1，…，(1/2)n。只要自交世代n足夠大，最終可使群體的雜合體（Aa）頻率趨于0，而純合體（AA和aa）頻率［=1-（1/2）n］趨于1。其他近交形式也有同樣的遺傳效應(yīng)，只不過使純合體頻率上升的速度比自交的要慢。由于近交可導(dǎo)致純合體化，就可有目的地對育種對象進行人工強制近交，通過選擇以保留對生產(chǎn)有利的基因和淘汰對生產(chǎn)不利的基因，這樣就可選出不同類型的性狀、優(yōu)良的近交系或自交系。不同的近交系或自交系間雜交，就可能選育出具有強優(yōu)勢的雜種一代組合，供生產(chǎn)利用雜種一代優(yōu)勢。也可以利用雜交和近交相結(jié)合的方法，選育出在生產(chǎn)上應(yīng)用的遺傳上穩(wěn)定的新品種。天然異交生物，由于隱性有害基因主要存在于雜合體中而不能表達。一旦近交，隱性有害基因以純合體形式存在而得到表現(xiàn)，例如玉米自交后代常分離出白化苗、黃苗和畸形苗等。所以，對于天然異交生物，近交往往有害。但對于天然近交生物或自交生物，近交不會有害，這是因為在長期自然選擇過程中，保留下來的幾乎全是對生存有利的基因。對于這些天然近交生物，在生產(chǎn)上應(yīng)盡量采用近交，以保持優(yōu)良性狀的相對一致性，即保持優(yōu)良品種的“種性”。
