一、反復(fù)凍融法:
2. 至少3次以上凍溶。
3. IFCC推薦法:
二、超聲波處理法
3. 100ml菌液離心,用8ml緩沖液懸浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超聲處理。750W 40%功率。5秒超聲,9秒間隔。超聲至少90min。
4. 綜合凍融和超聲的方法:
三、滲透法:
四、裂解液處理法:
2. 在loading buffer加SDS,100度5分鐘,是變性方法。SDS與蛋白等量結(jié)合,可以通過(guò)條帶位移判斷蛋白大小,考染不會(huì)影響結(jié)果。
3. 如果是做小量菌液,跑PAGE膠看其表達(dá)情況的話,可以直接加蛋白loading buffer煮沸5分鐘即可,需注意的是上樣前要離心12000rpm至少5分鐘,然后上樣時(shí),槍頭別吸最底下的。
4. 20毫升細(xì)胞裂解液配方:40 μL 0.5M EDTA (PH8.0),4 ml 10% SDS,1 ml 1M Tris-cl(PH6.8),14.96 ml 蒸餾水。
5. 我始終未明白樓主如果想收集全蛋白,而不考慮包涵體的話,為何要用超聲呢?直接水煮不就可以了嗎?
6. 將1ml菌離心棄上清,留大概50ul,再加50ul 2×上樣緩沖液,煮10min,取20ul上樣,就可以了。
7. 檢測(cè)蛋白誘導(dǎo):
8. 5-10秒離心,棄除上清,用50ul蒸餾水重懸沉淀。加入1ul PMSF,再加入50ul熱的2×SDS上樣緩沖液(100℃加熱)。迅速混勻后100℃加熱3-5min。將樣品冰上放置(或-20℃放置),然后再溶解,煮沸1min。離心30秒。上樣5ul進(jìn)行SDS-PAGE電泳。
9. 裂解液:50mMTris-HCl(pH8.5~9.0),2mMEDTA,100mMNaCl,0.5%TritonX-100,1mg/ml溶菌酶。
10. 我們用NP40(NP40:NONIDET p-40 乙基苯基聚乙二醇,是一種非離子表面活性劑。)加DTT和蛋白酶抑制劑裂解細(xì)胞,冰上放30-60min,然后13000rpm離心15min,取上清定量。
11. 裂解液配方是:50mmol/L Tirs-HCI (PH 8.0),150mmol/L NaCI,0. 02% 疊氮鈉,100μg/ml PMSF,1μg/ml Aprotinin,1% Triton X-100 ( or NP-40)。
12. 對(duì)于組織培養(yǎng)中生長(zhǎng)的細(xì)胞,最有效的裂解方法是用去污劑(表面活性劑)進(jìn)行處理,溶解細(xì)胞膜并溶解蛋白質(zhì)。50mmol/L Tirs-HCl(PH 8.0)、150mmol/L NaCl、0. 02% 疊氮鈉、100μg/ml PMSF、1μg/ml Aprotinin、1% Triton X-100 ( or NP-40) ,這種裂解液可能是最常用的裂解緩沖液。
13. 細(xì)胞裂解液的主要目的:
(1)利用去污劑破壞脂質(zhì)雙分子層,破裂細(xì)胞;
(2)溶解蛋白;
(3)蛋白變性使其穩(wěn)定;
(4)抑制蛋白酶活性。
14. 裂解buffer:50mM HEPES pH7.0,1mM 甘油,1mM DTT(還原劑),7M 尿素,2M硫脲(可以提高膜蛋白的融解),1mM EDTA(金屬鏊合劑),1mM PMSF,1mg/ml leupeptin,1mg/ml aprotinin,1mg/ml pepstatin(蛋白酶抑制劑),50mM NaF(ph7.0)(anti hemoaggulating),1mM Na3VO4(ph7.0)(inhibitor of phosphatases),2mM benzamidine(inhibitor of trypsin)。
15. 可選擇:取0.5ml誘導(dǎo)的細(xì)胞并離心2min。棄除上清,用100ul 1×SDS上樣緩沖液重懸,冰上放置。
16. 收集細(xì)胞。在液氮中突然冷凍細(xì)胞。用含有蛋白酶抑制劑的PBS緩沖液懸浮沉淀。用100 μg/ml溶菌酶處理并在冰上孵育15 min。加上10% N-laurylsarcosine (終濃度1.5%),然后超聲波破碎。16000 rpm×30 min離心。取上清然后加入Triton X-100至終濃度為2.0%。過(guò)Ni-NTA–瓊脂糖柱層析。
1. 將細(xì)胞在-20度以下冰凍,室溫融解,反復(fù)幾次,由于細(xì)胞內(nèi)冰粒形成和剩余細(xì)胞液的鹽濃度增高引起溶脹,使細(xì)胞結(jié)構(gòu)破碎。
2. 至少3次以上凍溶。
3. IFCC推薦法:
收集細(xì)胞懸液,4℃低溫離心(3000rpm,5min),棄上清,加入一定量PBS(200ul),輕輕吹打混勻,-200C 冷凍30 min,370C 解凍,如此反復(fù)3次,可形成細(xì)胞裂解液。
4. 用液氮凍融三四次就可以了,細(xì)胞凍住后,取出放37度水浴,溶解后震蕩,再凍
二、超聲波處理法
1. 要設(shè)定好超聲時(shí)間和間隙時(shí)間,一般超聲時(shí)間不超過(guò)5秒,間隙時(shí)間最好大于超聲時(shí)間,這些都有利于保護(hù)酶的活性。我的實(shí)驗(yàn)超聲時(shí)間5秒、間隙時(shí)間10秒、工作次數(shù)20次。
2. 每個(gè)樣本超聲時(shí)間5秒,每個(gè)間隔5秒,粉碎5次。
3. 100ml菌液離心,用8ml緩沖液懸浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超聲處理。750W 40%功率。5秒超聲,9秒間隔。超聲至少90min。
4. 綜合凍融和超聲的方法:
1500g離心,棄除上清。冰上,用小體積PBS重懸細(xì)胞。
將重懸液集中,1500g離心濃縮,棄除上清。液氮驟冷。用約5倍體積的PBS緩沖液重懸細(xì)胞,并攪拌。
可選擇:4℃下超聲破碎細(xì)胞。加入終濃度為0.25M的KCl,15mM的DTT。4℃下111500g×60min離心裂解液。取出上清。過(guò)柱子。
Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli-Alternate Protocol
三、滲透法:
冰冷的20 mmol/L Tris-Cl(pH8.0),2.5 mmol/L EDTA處理,冰浴放置10min。
《精編分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)指南》
四、裂解液處理法:
1. 細(xì)胞裂解液:50 mmol/L Tris-Cl pH 6.8,100 mmol/L DTT,2% SDS,0.1%溴酚藍(lán),10%甘油。SDS是陰離子型表面活性劑、極易促溶、強(qiáng)變性作用。
2. 在loading buffer加SDS,100度5分鐘,是變性方法。SDS與蛋白等量結(jié)合,可以通過(guò)條帶位移判斷蛋白大小,考染不會(huì)影響結(jié)果。
3. 如果是做小量菌液,跑PAGE膠看其表達(dá)情況的話,可以直接加蛋白loading buffer煮沸5分鐘即可,需注意的是上樣前要離心12000rpm至少5分鐘,然后上樣時(shí),槍頭別吸最底下的。
4. 20毫升細(xì)胞裂解液配方:40 μL 0.5M EDTA (PH8.0),4 ml 10% SDS,1 ml 1M Tris-cl(PH6.8),14.96 ml 蒸餾水。
5. 我始終未明白樓主如果想收集全蛋白,而不考慮包涵體的話,為何要用超聲呢?直接水煮不就可以了嗎?
6. 將1ml菌離心棄上清,留大概50ul,再加50ul 2×上樣緩沖液,煮10min,取20ul上樣,就可以了。
7. 檢測(cè)蛋白誘導(dǎo):
從培養(yǎng)的不同時(shí)期各取出1ml,12000g×1min離心。將沉淀重懸于100ul 1×SDS上樣緩沖液(50mM Tris-Cl(pH6.8),100mM DTT,2%SDS,0.1%溴酚藍(lán),10%甘油)中,100℃加熱3min,然后12000g×1min離心。上樣15ul,6%SDS-PAGE電泳。
《分子克隆》P826
8. 5-10秒離心,棄除上清,用50ul蒸餾水重懸沉淀。加入1ul PMSF,再加入50ul熱的2×SDS上樣緩沖液(100℃加熱)。迅速混勻后100℃加熱3-5min。將樣品冰上放置(或-20℃放置),然后再溶解,煮沸1min。離心30秒。上樣5ul進(jìn)行SDS-PAGE電泳。
2×SDS上樣緩沖液:250mM Tris-Cl,6.2%(w/v)DTT,8%SDS,0.002%(w/v)溴酚藍(lán),40%甘油。
Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli。
9. 裂解液:50mMTris-HCl(pH8.5~9.0),2mMEDTA,100mMNaCl,0.5%TritonX-100,1mg/ml溶菌酶。
10. 我們用NP40(NP40:NONIDET p-40 乙基苯基聚乙二醇,是一種非離子表面活性劑。)加DTT和蛋白酶抑制劑裂解細(xì)胞,冰上放30-60min,然后13000rpm離心15min,取上清定量。
11. 裂解液配方是:50mmol/L Tirs-HCI (PH 8.0),150mmol/L NaCI,0. 02% 疊氮鈉,100μg/ml PMSF,1μg/ml Aprotinin,1% Triton X-100 ( or NP-40)。
12. 對(duì)于組織培養(yǎng)中生長(zhǎng)的細(xì)胞,最有效的裂解方法是用去污劑(表面活性劑)進(jìn)行處理,溶解細(xì)胞膜并溶解蛋白質(zhì)。50mmol/L Tirs-HCl(PH 8.0)、150mmol/L NaCl、0. 02% 疊氮鈉、100μg/ml PMSF、1μg/ml Aprotinin、1% Triton X-100 ( or NP-40) ,這種裂解液可能是最常用的裂解緩沖液。
13. 細(xì)胞裂解液的主要目的:
(1)利用去污劑破壞脂質(zhì)雙分子層,破裂細(xì)胞;
(2)溶解蛋白;
(3)蛋白變性使其穩(wěn)定;
(4)抑制蛋白酶活性。
推薦RIPA buffer:50 mM Tris-HCl pH 7.4(緩沖體系),150 mM NaCl(等滲體系),1 mM PMSF (強(qiáng)大的蛋白酶抑制劑),1 mM EDTA(變性劑和穩(wěn)定劑),5 μg/ml Aprotinin(蛋白酶抑制劑),5 μg/ml Leupeptin(蛋白酶抑制劑),1% Triton x-100(破壞細(xì)胞),1% Sodium deoxycholate(中度變性劑和蛋白溶解劑),0.1% SDS(強(qiáng)變性劑和蛋白溶解劑)。
14. 裂解buffer:50mM HEPES pH7.0,1mM 甘油,1mM DTT(還原劑),7M 尿素,2M硫脲(可以提高膜蛋白的融解),1mM EDTA(金屬鏊合劑),1mM PMSF,1mg/ml leupeptin,1mg/ml aprotinin,1mg/ml pepstatin(蛋白酶抑制劑),50mM NaF(ph7.0)(anti hemoaggulating),1mM Na3VO4(ph7.0)(inhibitor of phosphatases),2mM benzamidine(inhibitor of trypsin)。
15. 可選擇:取0.5ml誘導(dǎo)的細(xì)胞并離心2min。棄除上清,用100ul 1×SDS上樣緩沖液重懸,冰上放置。
6000rpm×10min離心培養(yǎng)物。棄除上清,用10ml預(yù)冷的裂解液重懸沉淀。液氮驟冷細(xì)胞或-20℃冷凍細(xì)胞。在冷水中溶解細(xì)胞。15秒、4次超聲處理細(xì)胞。冰浴降溫。4℃,9000g×30min離心。取上清。
裂解液:5 mM DTT,15 mM KCl,5 mM MgCl2,50 mM HEPES, pH 7.9,1 mM EDTA,10 mg/ml溶菌酶(臨用前加上DTT和溶菌酶)。
Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli-Basic Protocol
16. 收集細(xì)胞。在液氮中突然冷凍細(xì)胞。用含有蛋白酶抑制劑的PBS緩沖液懸浮沉淀。用100 μg/ml溶菌酶處理并在冰上孵育15 min。加上10% N-laurylsarcosine (終濃度1.5%),然后超聲波破碎。16000 rpm×30 min離心。取上清然后加入Triton X-100至終濃度為2.0%。過(guò)Ni-NTA–瓊脂糖柱層析。